化药研发起始于公司成立之初，早在2004年，盈科瑞已经取得了第一个化药临床批件。正式搭建于2015年，下设4个研发平台，雾化吸入制剂研发平台、纳米&原位凝胶研发平台、原料药物研发平台以及创新药物研发平台。

盈科瑞成立以来，获得多个中药临床批件、新药证书、生产批件，涌现了不少明星品种，例如金莲清热泡腾片、银杏酮酯滴丸、心达康滴丸、胶体果胶铋胶囊、双黄连泡腾片和抗病毒咀嚼片等。

产业版块搭建于2017年8月，主要开展中药新药、化药新药、无菌制剂等创新品种中试放大、生产工艺验证、临床样品试制、质量检测的创新型智能化创新医药中试验证和产业化。

国际版块搭建于2018年底，是盈科瑞研发的创新药物和研发服务走向国际化，进行国际药物注册和国际知识产权保护的版块，下设有药物国际研发合作平台和核酸药物研发平台。